Il manoscritto è numerato in folia e capitoli, e la numerazione visibile oggi è opera di alcuni ritocchi: nel 16 secolo Gerald Plunkett di Dublino aggiunse una serie di numeri romani ai capitoli dell'evangelario, in accordo con la suddivisione ideata nel 13 secolo da parte dell'Arcivescovo di Canterbury Stephen Langton. Il chierico James Ussher contò e numerò i folia nel 1621, opera dopo la quale egli venne eletto vescovo di Meath. La regina Vittoria ed il Principe Alberto vennero invitati a firmare il codice nel 1849, e dunque essi eseguirono la propria firma autografa su di un folio erroneamente ritenuto appartenente agli originali del codice, e dunque esso venne rimosso durante la definitiva rilegatura del manoscritto avvenuta nel 1953.